73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0456 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  99.45 
 
 
182 aa  359  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  93.01 
 
 
186 aa  342  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  83.06 
 
 
182 aa  295  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  52.35 
 
 
175 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  49.09 
 
 
184 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  53.25 
 
 
180 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  47.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.54 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  40.85 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.72 
 
 
171 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  44.31 
 
 
167 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  44.94 
 
 
169 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  41.92 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.42 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  40.12 
 
 
170 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.62 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  43.03 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  39.66 
 
 
193 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  39.66 
 
 
193 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.08 
 
 
183 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.12 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  39.11 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  39.11 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  39.11 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  39.11 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  38.73 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  40.12 
 
 
185 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.31 
 
 
178 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  42.24 
 
 
173 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  38.55 
 
 
193 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.75 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.4 
 
 
164 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  35.4 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.4 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  38.85 
 
 
172 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  38.85 
 
 
172 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  38.85 
 
 
172 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  40.13 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  36.31 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  36.31 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.31 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  30.49 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  32.21 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  32.67 
 
 
248 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  29.92 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  27.59 
 
 
235 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  33.83 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.68 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  33.93 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  32.43 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.34 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.63 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  30.77 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.14 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  25.49 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.85 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>