More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0254 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
546 aa  1089    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  99.82 
 
 
555 aa  1087    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  99.82 
 
 
555 aa  1087    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  99.82 
 
 
558 aa  1087    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.16 
 
 
541 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.5 
 
 
558 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  99.82 
 
 
558 aa  1087    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 
558 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.05 
 
 
558 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  95.6 
 
 
558 aa  1023    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.57 
 
 
558 aa  883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
546 aa  1089    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.98 
 
 
558 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.32 
 
 
558 aa  866    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.05 
 
 
558 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.32 
 
 
558 aa  866    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
546 aa  1089    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.23 
 
 
606 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.12 
 
 
539 aa  555  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.03 
 
 
540 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  58.29 
 
 
540 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.29 
 
 
540 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.85 
 
 
540 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.2 
 
 
540 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  58.78 
 
 
540 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  56.59 
 
 
542 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  57.51 
 
 
542 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  57.9 
 
 
540 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
564 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
564 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  43.35 
 
 
622 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.44 
 
 
696 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
525 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 
549 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  30.85 
 
 
541 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
519 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  28.87 
 
 
544 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
540 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.31 
 
 
547 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.41 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 
550 aa  164  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 
544 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
679 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 
673 aa  160  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
571 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 
547 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
540 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.36 
 
 
539 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.05 
 
 
549 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
547 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 
612 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0159313  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 
541 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 
661 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 
542 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 
528 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
520 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.72 
 
 
660 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.57 
 
 
549 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 
535 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  30.32 
 
 
549 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  25.05 
 
 
543 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 
542 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 
541 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  29 
 
 
541 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  26.04 
 
 
546 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 
674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 
528 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 
539 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
658 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  26.98 
 
 
539 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 
535 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 
541 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
830 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  27.85 
 
 
541 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  25.23 
 
 
543 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
532 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 
693 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.26 
 
 
544 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 
571 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.48 
 
 
637 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 
554 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  28.2 
 
 
660 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 
533 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  24.27 
 
 
579 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 
570 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  28.19 
 
 
660 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 
644 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.99 
 
 
452 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>