58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0085 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1229  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  100 
 
 		 1011 bp  2004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000923659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  100 
 
 		 933 bp  1850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0070    100 
 
 		 1921 bp  3808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00134246  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1509  sensor histidine kinase  100 
 
 		 1011 bp  2004    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0046637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  100 
 
 		 969 bp  1921    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0085    100 
 
 		 1921 bp  3808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  99.17 
 
 		 1932 bp  3715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  98.91 
 
 		 1932 bp  3675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  99.02 
 
 		 1932 bp  3691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1573  C4-dicarboxylate transport transcriptional response regulator  100 
 
 		 1419 bp  176  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000200154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  91.18 
 
 		 2007 bp  87.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  89.71 
 
 		 2034 bp  79.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  89.71 
 
 		 2034 bp  79.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  89.71 
 
 		 2034 bp  79.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  89.71 
 
 		 2034 bp  79.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 1896 bp  71.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 1917 bp  71.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.24 
 
 		 2052 bp  71.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.67 
 
 		 1884 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.32 
 
 		 2007 bp  69.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  79.89 
 
 		 1905 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.11 
 
 		 1905 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  93.18 
 
 		 1866 bp  63.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.11 
 
 		 1905 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  86.76 
 
 		 2001 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.11 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  85.33 
 
 		 1776 bp  61.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  85.33 
 
 		 1980 bp  61.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  85.92 
 
 		 1998 bp  61.9  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  88.68 
 
 		 1866 bp  58  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  86.15 
 
 		 1917 bp  58  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  84.72 
 
 		 1884 bp  56  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  83.75 
 
 		 1815 bp  56  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  81.03 
 
 		 1908 bp  56  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  81.03 
 
 		 1848 bp  56  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1722 bp  54  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.51 
 
 		 1869 bp  54  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.51 
 
 		 2019 bp  54  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  84 
 
 		 1938 bp  54  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.29 
 
 		 1794 bp  52  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.85 
 
 		 1809 bp  52  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  83.33 
 
 		 1839 bp  52  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.48 
 
 		 1959 bp  52  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  83.33 
 
 		 1908 bp  52  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  84.62 
 
 		 1893 bp  50.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  86.79 
 
 		 1881 bp  50.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  81.72 
 
 		 2001 bp  50.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  93.94 
 
 		 2589 bp  50.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  91.67 
 
 		 2454 bp  48.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  93.75 
 
 		 1182 bp  48.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.33 
 
 		 1872 bp  48.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  88.64 
 
 		 1809 bp  48.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  87.5 
 
 		 1437 bp  48.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 2493 bp  48.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  93.75 
 
 		 1872 bp  48.1  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 2091 bp  48.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  91.67 
 
 		 1851 bp  48.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 222 bp  48.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.641487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>