More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0074 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  40.31 
 
 
1004 aa  644  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0780  excinuclease ABC, A subunit  40.28 
 
 
948 aa  692  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0344359  normal  0.338126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0521  excinuclease ABC, A subunit  38.64 
 
 
948 aa  669  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.276548  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0942  hypothetical protein  37.17 
 
 
950 aa  639  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0226  hypothetical protein  38.49 
 
 
935 aa  697  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.544357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  38.93 
 
 
939 aa  650  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0455  excinuclease ABC, A subunit  38.65 
 
 
951 aa  642  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  41.11 
 
 
920 aa  719  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.16 
 
 
944 aa  675  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  86.04 
 
 
1983 aa  3340  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  81.17 
 
 
1949 aa  3194  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  44.82 
 
 
1840 aa  1494  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  39.44 
 
 
943 aa  696  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  85.89 
 
 
1997 aa  3362  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  38.81 
 
 
946 aa  674  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0677  excinuclease ABC, A subunit  40.86 
 
 
956 aa  704  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0725474 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  40.32 
 
 
948 aa  679  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  39.49 
 
 
940 aa  645  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  38.68 
 
 
958 aa  667  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  38.38 
 
 
958 aa  663  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  39.24 
 
 
1002 aa  660  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  40.51 
 
 
957 aa  675  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  38.68 
 
 
958 aa  667  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  58.83 
 
 
2017 aa  1701  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  37.43 
 
 
947 aa  641  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  38.48 
 
 
958 aa  664  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  39.64 
 
 
947 aa  678  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  39.43 
 
 
965 aa  645  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1194  excinuclease ABC subunit A  37.26 
 
 
932 aa  641  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1118  excinuclease ABC subunit A  40.53 
 
 
996 aa  640  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  43.57 
 
 
1995 aa  1505  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  90.21 
 
 
1996 aa  3529  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  69.11 
 
 
1935 aa  2647  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  38.67 
 
 
954 aa  680  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  39.2 
 
 
936 aa  669  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  38.51 
 
 
973 aa  639  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 
956 aa  661  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  40.56 
 
 
995 aa  662  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  37.75 
 
 
951 aa  644  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1601  excinuclease ABC, A subunit  37.74 
 
 
960 aa  643  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.409115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 
948 aa  678  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  39.07 
 
 
921 aa  690  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  41.42 
 
 
972 aa  655  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  41.65 
 
 
975 aa  660  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  1.62445e-05 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  40.2 
 
 
954 aa  681  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  9.42847e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 
948 aa  678  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  41.74 
 
 
945 aa  684  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  41.5 
 
 
965 aa  666  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  42.26 
 
 
987 aa  696  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0303  excinuclease ABC, A subunit  40.12 
 
 
989 aa  639  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  90.87 
 
 
1964 aa  3545  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  40.81 
 
 
916 aa  697  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  41.16 
 
 
946 aa  665  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.43 
 
 
927 aa  705  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  38.92 
 
 
959 aa  666  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  38.76 
 
 
954 aa  681  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  90.58 
 
 
1974 aa  3496  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  38.58 
 
 
939 aa  690  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  37.89 
 
 
948 aa  640  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  68.25 
 
 
1984 aa  2681  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  39.72 
 
 
979 aa  677  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  37.94 
 
 
954 aa  646  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  41.11 
 
 
916 aa  702  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1823  excinuclease ABC, A subunit  39.42 
 
 
956 aa  644  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4831  excinuclease ABC subunit A  39.96 
 
 
978 aa  660  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  38.77 
 
 
946 aa  670  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  40.92 
 
 
965 aa  658  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  40.97 
 
 
958 aa  660  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  39.53 
 
 
982 aa  647  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  40.78 
 
 
946 aa  663  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  42.14 
 
 
962 aa  721  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0081  excinuclease ABC, A subunit  40.63 
 
 
981 aa  679  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3637  excinuclease ABC, A subunit  44.08 
 
 
1847 aa  1399  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0024  excinuclease ABC, A subunit  40.95 
 
 
940 aa  647  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  40.77 
 
 
955 aa  684  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  41.56 
 
 
1055 aa  647  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  41.83 
 
 
963 aa  679  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.93672e-06  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.52 
 
 
957 aa  660  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  40.24 
 
 
946 aa  668  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  39.8 
 
 
983 aa  664  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5040  excinuclease ABC, A subunit  37.69 
 
 
971 aa  666  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09248  excinuclease ABC subunit A  41.39 
 
 
927 aa  695  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  41.97 
 
 
980 aa  704  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  40.46 
 
 
946 aa  661  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  40.74 
 
 
952 aa  646  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  41.38 
 
 
957 aa  662  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  32.59 
 
 
1942 aa  698  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1595  excinuclease ABC, A subunit  36.01 
 
 
2434 aa  780  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  41.24 
 
 
961 aa  669  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  41.68 
 
 
979 aa  698  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2142  excinuclease ABC, A subunit  41.52 
 
 
949 aa  657  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.364139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  42.56 
 
 
963 aa  693  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  39.86 
 
 
964 aa  673  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5457  excinuclease ABC, A subunit  38.96 
 
 
997 aa  676  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.96899  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  39.7 
 
 
963 aa  681  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0318  excinuclease ABC, A subunit  38.69 
 
 
1006 aa  649  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  40.66 
 
 
971 aa  641  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3281  excinuclease ABC, A subunit  39.28 
 
 
950 aa  671  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  39.74 
 
 
947 aa  680  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119e-25 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  81.17 
 
 
1949 aa  3194  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>