More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0058 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  80.85 
 
 
452 aa  667  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  80.49 
 
 
459 aa  678  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 
452 aa  882  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 
452 aa  882  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  99.34 
 
 
452 aa  879  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  99.78 
 
 
452 aa  880  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  79.96 
 
 
457 aa  682  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  99.78 
 
 
452 aa  880  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  80 
 
 
457 aa  674  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  80.85 
 
 
452 aa  655  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 
452 aa  882  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  80.89 
 
 
460 aa  672  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  78.49 
 
 
476 aa  669  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  93.58 
 
 
465 aa  782  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 
452 aa  882  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  79.82 
 
 
459 aa  681  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  82.18 
 
 
451 aa  681  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  79.9 
 
 
406 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  60.09 
 
 
462 aa  465  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  60.69 
 
 
453 aa  459  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  58.07 
 
 
490 aa  439  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  52.67 
 
 
453 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  60.46 
 
 
453 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  61.52 
 
 
453 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  52.57 
 
 
453 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.36 
 
 
450 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.74 
 
 
454 aa  417  1e-115  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.36 
 
 
450 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.83 
 
 
450 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  53.88 
 
 
450 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  52.67 
 
 
450 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  51.74 
 
 
452 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  56.25 
 
 
459 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  55.56 
 
 
459 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  47.81 
 
 
438 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.77 
 
 
450 aa  358  1e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  43.68 
 
 
446 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  44.06 
 
 
450 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  44.34 
 
 
473 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  45.39 
 
 
448 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  42.18 
 
 
449 aa  343  3e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  43.36 
 
 
449 aa  342  6e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  43.88 
 
 
458 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.62 
 
 
460 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  43.72 
 
 
456 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  42.82 
 
 
450 aa  328  1e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  43.88 
 
 
450 aa  326  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  3.53189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  50.34 
 
 
452 aa  322  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  45.5 
 
 
457 aa  320  4e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  40.81 
 
 
476 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  42.26 
 
 
452 aa  310  3e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  45.54 
 
 
455 aa  305  1e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  38.9 
 
 
454 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  38.9 
 
 
454 aa  289  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  38.25 
 
 
454 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  38.62 
 
 
454 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1579  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.82 
 
 
448 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1657  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.6 
 
 
404 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.919998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  37.1 
 
 
451 aa  274  2e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1855  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.54 
 
 
419 aa  273  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13030  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.52 
 
 
462 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  36.02 
 
 
445 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  39.63 
 
 
477 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3324  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.62 
 
 
402 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  37 
 
 
454 aa  253  5e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  37.64 
 
 
483 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  38.02 
 
 
483 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
453 aa  249  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  39.58 
 
 
477 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  37.81 
 
 
452 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  36.94 
 
 
455 aa  239  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0298  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.42 
 
 
444 aa  237  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  36.71 
 
 
455 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4654  fumarate lyase  43.24 
 
 
451 aa  236  5e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179746  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 
471 aa  232  8e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1055  fumarate lyase  38.46 
 
 
488 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4654  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.63 
 
 
464 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0817649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  42.03 
 
 
451 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3852  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  49.1 
 
 
384 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0767232  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  35.48 
 
 
454 aa  227  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  36.57 
 
 
450 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  35.45 
 
 
446 aa  220  4e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2833  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.47 
 
 
464 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  33.79 
 
 
448 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  40.66 
 
 
463 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  32.35 
 
 
448 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  34.16 
 
 
451 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  34.39 
 
 
446 aa  201  2e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2457  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.62 
 
 
383 aa  200  4e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00336692  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  33.73 
 
 
456 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  30.89 
 
 
449 aa  198  2e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2324  fumarate lyase  34.3 
 
 
500 aa  198  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  31.44 
 
 
446 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  32.49 
 
 
449 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  34.56 
 
 
435 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  31.35 
 
 
449 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  30.66 
 
 
449 aa  191  3e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  31.82 
 
 
446 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  31.12 
 
 
447 aa  186  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  32.95 
 
 
445 aa  183  4e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>