More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3529 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  99.4 
 
 
171 aa  342  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  99.4 
 
 
171 aa  342  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  99.4 
 
 
171 aa  342  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  99.4 
 
 
222 aa  342  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  99.4 
 
 
171 aa  342  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  99.4 
 
 
222 aa  342  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  98.21 
 
 
171 aa  339  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  94.64 
 
 
218 aa  330  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  94.61 
 
 
171 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  94.61 
 
 
174 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  94.01 
 
 
174 aa  324  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  93.41 
 
 
174 aa  323  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  93.41 
 
 
174 aa  323  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  93.41 
 
 
174 aa  323  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  82.74 
 
 
171 aa  284  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  83.83 
 
 
165 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  82.63 
 
 
165 aa  283  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 
164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 
163 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  65.27 
 
 
162 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  65.27 
 
 
162 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  65.27 
 
 
162 aa  227  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  56.97 
 
 
157 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
157 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  56.36 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 
160 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.9 
 
 
156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  48.45 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  48.45 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  46.88 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  47.9 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
153 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  47.83 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
152 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  46.34 
 
 
162 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.51 
 
 
152 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
154 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 
177 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.42 
 
 
154 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  43.11 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.51 
 
 
164 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.31 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  41.92 
 
 
164 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  46.11 
 
 
156 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  47.31 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
163 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
154 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
154 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
172 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  41.92 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.31 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  39.76 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.36 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.92 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
157 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
156 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40.72 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  45.51 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  40.36 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  45.51 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.42 
 
 
175 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
160 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
160 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
159 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
160 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>