More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3320 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  100 
 
 
399 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  100 
 
 
399 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  99.5 
 
 
405 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  92.73 
 
 
399 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
399 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
399 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  100 
 
 
399 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  100 
 
 
399 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  82.21 
 
 
399 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  81.95 
 
 
399 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  82.71 
 
 
399 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  80.95 
 
 
399 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  83.38 
 
 
385 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
406 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
406 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  43.23 
 
 
399 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  43.23 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  43.23 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  45.55 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 
423 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  43.6 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
394 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
394 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
394 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  44.89 
 
 
394 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.16 
 
 
394 aa  269  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 
399 aa  270  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.16 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.16 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.16 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  44.62 
 
 
394 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.16 
 
 
394 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  40.31 
 
 
426 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.3 
 
 
394 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.9 
 
 
394 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  39.95 
 
 
393 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
404 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  42.82 
 
 
383 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  42.43 
 
 
405 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.43 
 
 
405 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.98 
 
 
405 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
399 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  42.23 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  42.23 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  42.23 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 
411 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  40.05 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
399 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 
403 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  41.94 
 
 
401 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.81 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.81 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  43.23 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  39.8 
 
 
401 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  43.29 
 
 
404 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  43.58 
 
 
399 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  40.31 
 
 
401 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  42.44 
 
 
398 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
429 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
429 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  41.18 
 
 
402 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
413 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.9 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  39.29 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  39.2 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.9 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.18 
 
 
401 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
413 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.63 
 
 
400 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  40.78 
 
 
398 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  42.93 
 
 
409 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  41.49 
 
 
411 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  41.49 
 
 
411 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.83 
 
 
404 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  41.22 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
391 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
447 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  41.13 
 
 
390 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  41.42 
 
 
391 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 
422 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  39.12 
 
 
407 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 
394 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
394 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.32 
 
 
415 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  42.9 
 
 
394 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.66 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  37.17 
 
 
410 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  38.73 
 
 
398 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  36.6 
 
 
407 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  43.43 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  40.82 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
428 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  43.22 
 
 
399 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  42.3 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>