150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2743 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3670  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2972  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000863002  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3261  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1810  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3645  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3702  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2743  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00244932  hitchhiker  0.00000298756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.669511  normal  0.713856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.567197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_003295  RS00327  tRNA-Thr  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0054  tRNA-Thr  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0055  tRNA-Thr  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0075  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0068  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0055  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231554  normal  0.162704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0024  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0014  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0011  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0011  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0488568  normal  0.109473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0027  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00584174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0417  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00804447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>