More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2534 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  100 
 
 
284 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  100 
 
 
275 aa  358  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  99.44 
 
 
180 aa  356  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  98.89 
 
 
180 aa  353  9e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  91.11 
 
 
180 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  90 
 
 
180 aa  330  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  90 
 
 
180 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  90 
 
 
180 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
180 aa  326  1e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  88.33 
 
 
180 aa  323  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 
180 aa  322  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  87.98 
 
 
183 aa  321  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  88.33 
 
 
180 aa  300  6e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  86.63 
 
 
183 aa  299  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 
181 aa  282  2e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
181 aa  277  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  75.14 
 
 
181 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
181 aa  271  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  74.59 
 
 
181 aa  271  5e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  63.78 
 
 
180 aa  220  1e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  62.57 
 
 
183 aa  217  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  64.85 
 
 
182 aa  215  3e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  59.24 
 
 
186 aa  212  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  59.78 
 
 
186 aa  213  2e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  61.11 
 
 
182 aa  211  3e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  67.28 
 
 
182 aa  210  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  60.56 
 
 
182 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  59.22 
 
 
184 aa  207  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 
172 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  63.89 
 
 
179 aa  196  2e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  57.78 
 
 
182 aa  196  2e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 
183 aa  196  2e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 
182 aa  195  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  61.39 
 
 
182 aa  194  5e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 
168 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  61.45 
 
 
171 aa  186  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 
176 aa  178  3e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  53.99 
 
 
173 aa  175  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  48.07 
 
 
194 aa  171  4e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.86 
 
 
133 aa  171  7e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  54.66 
 
 
173 aa  171  7e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  47.51 
 
 
194 aa  170  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  53.71 
 
 
173 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
164 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.57 
 
 
173 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 
164 aa  165  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 
173 aa  165  3e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.00533e-05  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  54.66 
 
 
173 aa  165  3e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 
173 aa  165  3e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.57 
 
 
173 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55.21 
 
 
173 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 
173 aa  164  6e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  47.51 
 
 
194 aa  163  1e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  54.66 
 
 
173 aa  163  1e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  52.98 
 
 
173 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  52 
 
 
173 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  54.66 
 
 
173 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
171 aa  160  8e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  52.15 
 
 
164 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  8.85772e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  5.71856e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.04743e-05  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
164 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.27 
 
 
165 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 
173 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
161 aa  157  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
174 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  52.2 
 
 
189 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  54.72 
 
 
179 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  45.68 
 
 
182 aa  154  5e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 
174 aa  152  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.86306e-05 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 
165 aa  150  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  53.42 
 
 
173 aa  150  9e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 
174 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  51.61 
 
 
175 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  51.18 
 
 
173 aa  146  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  52.84 
 
 
173 aa  146  2e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  52.35 
 
 
173 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  52.35 
 
 
173 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  46.63 
 
 
165 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  52.35 
 
 
173 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.25 
 
 
174 aa  145  4e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.28 
 
 
176 aa  145  4e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  51.18 
 
 
173 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 
174 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.56 
 
 
175 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>