More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2287 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  98.31 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  98.73 
 
 
237 aa  437  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  88.61 
 
 
332 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  57.76 
 
 
232 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 
233 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  56 
 
 
234 aa  222  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
234 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
234 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
234 aa  220  1e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  54.7 
 
 
234 aa  219  2e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  56 
 
 
234 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 
235 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 
235 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  52.17 
 
 
234 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  53.16 
 
 
234 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  52.79 
 
 
234 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  52.38 
 
 
234 aa  195  5e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 
234 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  49.55 
 
 
227 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.12 
 
 
235 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.75 
 
 
242 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.64 
 
 
258 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 
233 aa  178  5e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.32 
 
 
232 aa  178  5e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 
228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  44.93 
 
 
256 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 
228 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 
228 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  49.34 
 
 
231 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 
235 aa  162  5e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  40.26 
 
 
237 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
276 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
241 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
241 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
245 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 
245 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
243 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
247 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 
234 aa  147  1e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.84 
 
 
239 aa  147  2e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 
244 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.19132e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
243 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
237 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
237 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
265 aa  139  4e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
237 aa  135  6e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
238 aa  125  8e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
239 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
243 aa  112  4e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
235 aa  110  2e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
237 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
254 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
244 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.75 
 
 
304 aa  95.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  28.33 
 
 
244 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 
282 aa  88.2  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.07 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 
267 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
252 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
252 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
252 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
317 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.52 
 
 
283 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
227 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
300 aa  84.7  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
314 aa  84.7  1e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.16 
 
 
273 aa  84.3  1e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
298 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
271 aa  84  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
273 aa  82.8  4e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
307 aa  82.4  5e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
307 aa  82.4  5e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
290 aa  82  6e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.87582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.29 
 
 
272 aa  82  6e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 
286 aa  82  7e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00632e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.67 
 
 
253 aa  82  8e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  32.02 
 
 
219 aa  81.6  8e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
272 aa  81.6  9e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
247 aa  80.9  1e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>