More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1922 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  83.59 
 
 		 452 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  99.33 
 
 		 451 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  100 
 
 		 451 aa  878    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  83.59 
 
 		 453 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  100 
 
 		 451 aa  878    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  83.37 
 
 		 450 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  100 
 
 		 451 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  99.56 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  83.37 
 
 		 453 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  83.15 
 
 		 453 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  83.37 
 
 		 453 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  99.56 
 
 		 451 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 451 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  96.38 
 
 		 579 aa  784    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  77.55 
 
 		 454 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  83.59 
 
 		 452 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  78.54 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  58.84 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 		 463 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  44.34 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  50.73 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  51.12 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  39.24 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  39.01 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.18 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  40.61 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  39.49 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  39.4 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  41.84 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  38.51 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 447 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.38 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  42.09 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.11 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.88 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  37.39 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40 
 
 		 450 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  37.3 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  40.84 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 467 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  40 
 
 		 468 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.39 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  36.89 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36.07 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 452 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  39 
 
 		 449 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  38.03 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  33.86 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  42.33 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  42.33 
 
 		 450 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.65 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  38.3 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  37.73 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  38.05 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>