132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1829 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  1.11914e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  1.82494e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  99.37 
 
 
159 aa  319  1e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.0214e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  99.37 
 
 
159 aa  319  1e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  4.05365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  99.37 
 
 
159 aa  319  1e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  6.98436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  99.37 
 
 
159 aa  319  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  2.38483e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  99.37 
 
 
159 aa  319  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  95.62 
 
 
160 aa  307  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  3.20611e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  81.76 
 
 
167 aa  246  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  8.26192e-07  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  75.78 
 
 
161 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  5.90297e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  75.78 
 
 
161 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  2.43201e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  83.33 
 
 
160 aa  242  2e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  5.71035e-08  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  83.7 
 
 
161 aa  240  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.28234e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  82.96 
 
 
161 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  82.96 
 
 
161 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.9839e-06  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  82.96 
 
 
161 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.56218e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  72.61 
 
 
157 aa  237  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  79.14 
 
 
158 aa  234  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.3058e-09  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  79.56 
 
 
158 aa  234  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.34682e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  70.51 
 
 
158 aa  232  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  70.39 
 
 
169 aa  228  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  68.84 
 
 
159 aa  214  3e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  68.84 
 
 
159 aa  214  3e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  66.2 
 
 
178 aa  196  1e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  68.38 
 
 
168 aa  194  4e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  67.65 
 
 
168 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  60.74 
 
 
163 aa  186  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  63.83 
 
 
169 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  65.44 
 
 
167 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  63.5 
 
 
168 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  59.46 
 
 
157 aa  183  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  63.97 
 
 
168 aa  181  4e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  56.13 
 
 
156 aa  180  9e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  59.71 
 
 
156 aa  176  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  61.87 
 
 
172 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  59.03 
 
 
153 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  59.44 
 
 
153 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  58.62 
 
 
153 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  59.44 
 
 
153 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  62.2 
 
 
154 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  59.06 
 
 
154 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  53.19 
 
 
154 aa  164  3e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  58.27 
 
 
154 aa  164  6e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  58.78 
 
 
152 aa  162  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  58.78 
 
 
150 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  52.5 
 
 
161 aa  161  4e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  54.48 
 
 
160 aa  160  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  54.74 
 
 
155 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  54.74 
 
 
155 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  54.74 
 
 
155 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  52.26 
 
 
158 aa  157  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  54.01 
 
 
157 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  54.01 
 
 
162 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  54.01 
 
 
162 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  54.01 
 
 
157 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  54.01 
 
 
162 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  4.79478e-06  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  52.35 
 
 
160 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  2.48157e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  50.33 
 
 
156 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  53.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  47.3 
 
 
181 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  50.36 
 
 
164 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  6.58156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  50.39 
 
 
155 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  45.1 
 
 
184 aa  139  2e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  45.03 
 
 
184 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  47.37 
 
 
170 aa  137  4e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  48.85 
 
 
155 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  44.44 
 
 
173 aa  132  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  46.45 
 
 
166 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  49.58 
 
 
182 aa  125  2e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  41.61 
 
 
182 aa  125  2e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  47.06 
 
 
186 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  48.74 
 
 
180 aa  124  4e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  41.88 
 
 
176 aa  123  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  49.21 
 
 
161 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  46.22 
 
 
182 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  46.92 
 
 
179 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  45.9 
 
 
183 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  44.52 
 
 
183 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  45.83 
 
 
187 aa  119  1e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  37.13 
 
 
180 aa  116  2e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  40 
 
 
155 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  39.74 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  39.1 
 
 
165 aa  97.1  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  39.1 
 
 
165 aa  97.1  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5614  CreA family protein  34.01 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299882  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  38.1 
 
 
151 aa  94  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  37.5 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  38.67 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  36.77 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  36.17 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>