More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1750 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  988    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  987    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  84.75 
 
 
474 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
473 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  89.64 
 
 
480 aa  883    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1779  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  70.43 
 
 
476 aa  685    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  88.77 
 
 
474 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  65.75 
 
 
474 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  89.01 
 
 
473 aa  904    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  89.22 
 
 
473 aa  881    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  99.58 
 
 
503 aa  984    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2120  radical SAM domain protein  70.43 
 
 
476 aa  685    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.323478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  89.43 
 
 
473 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  89.01 
 
 
473 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  78.51 
 
 
470 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  82.88 
 
 
473 aa  842    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  89.85 
 
 
473 aa  883    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  90.27 
 
 
473 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  988    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  89.85 
 
 
473 aa  883    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  89.43 
 
 
473 aa  882    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  89.85 
 
 
473 aa  883    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  65.96 
 
 
474 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  63.85 
 
 
479 aa  631  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  63.21 
 
 
479 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  62.87 
 
 
474 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  62.87 
 
 
474 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  62.87 
 
 
474 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0973  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  62.66 
 
 
477 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  59.41 
 
 
478 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  58.6 
 
 
476 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  58 
 
 
479 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  58 
 
 
479 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  54.82 
 
 
497 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  49.79 
 
 
476 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  49.79 
 
 
476 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  49.37 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  48.73 
 
 
475 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  48.94 
 
 
476 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  48.3 
 
 
473 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  48.09 
 
 
473 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  48.82 
 
 
501 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  46.38 
 
 
475 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 
490 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  32.23 
 
 
485 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
459 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
576 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 
576 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 
583 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
472 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.23 
 
 
472 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.76 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.56 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
461 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 
473 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.79 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
529 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 
470 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
441 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
556 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 
494 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
494 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  25.54 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  25.54 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
564 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 
488 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  26.67 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.55 
 
 
512 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  31.68 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 
489 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  26.94 
 
 
487 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  29.22 
 
 
563 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
518 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 
459 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  27.38 
 
 
566 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
564 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 
516 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.94 
 
 
485 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
502 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 
462 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 
524 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 
469 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 
473 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.73 
 
 
612 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 
723 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.98 
 
 
546 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
1250 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.98 
 
 
546 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
450 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.76 
 
 
547 aa  97.1  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>