More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0801 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  99.67 
 
 
304 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
351 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
351 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  95.07 
 
 
344 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  88.82 
 
 
304 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  88.82 
 
 
326 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  88.49 
 
 
320 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  88.49 
 
 
304 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  88.82 
 
 
304 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  88.16 
 
 
373 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  88.82 
 
 
304 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  84.21 
 
 
304 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 
304 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 
304 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  71.06 
 
 
320 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 
320 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 
303 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 
321 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  67.76 
 
 
304 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  68.9 
 
 
355 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 
304 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  66.56 
 
 
345 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  66.89 
 
 
342 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  67.55 
 
 
325 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 
308 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  61.07 
 
 
314 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  58.75 
 
 
307 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  58.69 
 
 
323 aa  349  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  56.45 
 
 
314 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  63.14 
 
 
301 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  57.81 
 
 
322 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  59.59 
 
 
327 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  56.86 
 
 
313 aa  341  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  56.77 
 
 
312 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  58.5 
 
 
315 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  55.21 
 
 
315 aa  315  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  57.04 
 
 
311 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  58.02 
 
 
310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  51.85 
 
 
309 aa  305  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  50.34 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  48.86 
 
 
309 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  51 
 
 
311 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  48.86 
 
 
309 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
312 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  49.34 
 
 
326 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  48.25 
 
 
311 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  48.33 
 
 
339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  47.77 
 
 
310 aa  268  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  47.02 
 
 
303 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  48.32 
 
 
312 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  47.64 
 
 
310 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.82 
 
 
317 aa  261  6.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  45.76 
 
 
305 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  46.96 
 
 
310 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  46.91 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  51.01 
 
 
317 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.79 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  46.36 
 
 
307 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  44 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  44.97 
 
 
332 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  43.42 
 
 
305 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  42.81 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  43 
 
 
313 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.97 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.22 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
300 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  40.65 
 
 
305 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 
279 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
328 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
315 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 
339 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  40 
 
 
305 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.8 
 
 
309 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.56 
 
 
317 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.34 
 
 
310 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.25 
 
 
317 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
340 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.76 
 
 
279 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.13 
 
 
305 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.03 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.67 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.39 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  40.94 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.25 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.39 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 
327 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.6 
 
 
320 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.33 
 
 
319 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  45.58 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>