More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0749 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  76.73 
 
 
543 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  77.5 
 
 
552 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  100 
 
 
593 aa  927    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  77.5 
 
 
525 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  62.8 
 
 
515 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  100 
 
 
582 aa  1134    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  99.8 
 
 
615 aa  928    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  77.08 
 
 
529 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  100 
 
 
576 aa  927    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  95.04 
 
 
601 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  99.8 
 
 
585 aa  925    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  76.81 
 
 
515 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  99.8 
 
 
594 aa  927    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  77.25 
 
 
505 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  77.25 
 
 
505 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  100 
 
 
582 aa  1134    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  61.02 
 
 
604 aa  628  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  65.9 
 
 
514 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  54.91 
 
 
496 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  55.11 
 
 
496 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.39 
 
 
509 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.18 
 
 
509 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.98 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  55.44 
 
 
499 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.5 
 
 
509 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  53.19 
 
 
498 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  53.4 
 
 
494 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  48.95 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  43.68 
 
 
533 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  43.86 
 
 
483 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.36 
 
 
474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.33 
 
 
509 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.25 
 
 
509 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.71 
 
 
519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  39.77 
 
 
489 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.11 
 
 
490 aa  276  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  37.08 
 
 
504 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 
498 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 
498 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.32 
 
 
498 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.11 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  38 
 
 
505 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
498 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.62 
 
 
498 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.11 
 
 
515 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.44 
 
 
514 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.04 
 
 
498 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.15 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.08 
 
 
489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.18 
 
 
527 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  35.21 
 
 
502 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.82 
 
 
480 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
514 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.73 
 
 
502 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
493 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  37.09 
 
 
492 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
498 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
514 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
498 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
498 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.29 
 
 
502 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
498 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.82 
 
 
502 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.8 
 
 
499 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 
502 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.41 
 
 
699 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  36.32 
 
 
490 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.67 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.26 
 
 
493 aa  240  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.13 
 
 
517 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.37 
 
 
483 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.34 
 
 
517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
504 aa  233  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  41.77 
 
 
556 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38 
 
 
702 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.41 
 
 
491 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  34.73 
 
 
475 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.21 
 
 
553 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.21 
 
 
553 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.67 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.67 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.67 
 
 
527 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  37.67 
 
 
527 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.67 
 
 
527 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  37.67 
 
 
527 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.61 
 
 
483 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.02 
 
 
527 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 
527 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.34 
 
 
629 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  33.76 
 
 
484 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.33 
 
 
531 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.33 
 
 
531 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.33 
 
 
531 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.33 
 
 
531 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.84 
 
 
483 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
487 aa  203  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.6 
 
 
618 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.26 
 
 
616 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.26 
 
 
616 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>