More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0700 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 
157 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  98.75 
 
 
160 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  98.75 
 
 
160 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  98.12 
 
 
160 aa  314  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  89.87 
 
 
158 aa  279  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  78.23 
 
 
167 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 
157 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 
156 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 
156 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 
156 aa  233  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 
156 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  76.87 
 
 
152 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  73.47 
 
 
149 aa  225  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  73.65 
 
 
156 aa  223  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  71.23 
 
 
149 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 
153 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  56.94 
 
 
153 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  57.24 
 
 
153 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
146 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  50.82 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
340 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.82 
 
 
399 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  38.3 
 
 
258 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
163 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  40.91 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.5 
 
 
135 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.41 
 
 
221 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  32.29 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.19 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.53 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
324 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  32.29 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  51.72 
 
 
329 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 
430 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  24.62 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  35.11 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
398 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.65 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.35 
 
 
570 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
272 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.27 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.21 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  30.21 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1273  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.29 
 
 
213 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  26.17 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.27 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.21 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  31.52 
 
 
316 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>