More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0527 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  80.37 
 
 
477 aa  794  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  69.36 
 
 
471 aa  689  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  68.52 
 
 
471 aa  698  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  79.55 
 
 
477 aa  786  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  71.93 
 
 
473 aa  713  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
491 aa  1000  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  99.8 
 
 
491 aa  997  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  98.58 
 
 
494 aa  944  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  79.96 
 
 
477 aa  795  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  80.16 
 
 
477 aa  794  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  80.16 
 
 
477 aa  794  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  79.35 
 
 
477 aa  788  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  78.53 
 
 
483 aa  772  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
481 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  54.68 
 
 
471 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  54.47 
 
 
500 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  56.31 
 
 
469 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 
487 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
482 aa  540  1e-152  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  55.49 
 
 
469 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
491 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  55.28 
 
 
469 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  55.12 
 
 
473 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
469 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.99 
 
 
484 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  54.94 
 
 
483 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  51.76 
 
 
472 aa  506  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
477 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.29 
 
 
483 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
478 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
470 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
478 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  51.24 
 
 
489 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  52.27 
 
 
478 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  50.83 
 
 
470 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  51.45 
 
 
479 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
473 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.96 
 
 
470 aa  469  1e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  51.77 
 
 
481 aa  466  1e-130  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 
476 aa  460  1e-128  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  51.45 
 
 
472 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
473 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
472 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.9 
 
 
473 aa  445  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  47.93 
 
 
472 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.47 
 
 
483 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  45.02 
 
 
483 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.23 
 
 
472 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  49.69 
 
 
482 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  47 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  47 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  47 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  46.69 
 
 
468 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  47 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  47 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  46.69 
 
 
468 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  46.69 
 
 
468 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  45.88 
 
 
433 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  46.69 
 
 
468 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
433 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.69 
 
 
468 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  46.49 
 
 
468 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  5.83102e-14 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 
468 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
468 aa  417  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  6.34797e-11 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  42.8 
 
 
475 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  42.74 
 
 
468 aa  407  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.45 
 
 
483 aa  406  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 
470 aa  408  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  42.86 
 
 
473 aa  406  1e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
473 aa  408  1e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  42.74 
 
 
463 aa  407  1e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 
470 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
470 aa  408  1e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
473 aa  407  1e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.6 
 
 
477 aa  406  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
479 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.98 
 
 
470 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  44.01 
 
 
532 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 
479 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
473 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
469 aa  399  1e-110  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 
477 aa  401  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
478 aa  400  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
475 aa  400  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  44.95 
 
 
493 aa  399  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
472 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  44.35 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
474 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  43.18 
 
 
478 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.65 
 
 
475 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  43.15 
 
 
470 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>