More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0420 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  99.72 
 
 		 354 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 352 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  99.7 
 
 		 333 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 355 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 352 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  94.3 
 
 		 355 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 355 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  95.44 
 
 		 355 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  98.86 
 
 		 354 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 352 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  99.72 
 
 		 354 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 355 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  99.72 
 
 		 354 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 355 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 355 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  90.62 
 
 		 354 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  89.77 
 
 		 354 aa  621  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  88.07 
 
 		 354 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  74.86 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  74.58 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  73.45 
 
 		 354 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  72.6 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  71.75 
 
 		 354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  70.62 
 
 		 357 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  70.62 
 
 		 357 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  65.53 
 
 		 352 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  65.25 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  63.41 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.07 
 
 		 359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.38 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  62.57 
 
 		 358 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  62.85 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.29 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.73 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.71 
 
 		 349 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.22 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  61.81 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.66 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  62.5 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  61.8 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.31 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  61.77 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  58.26 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  57.36 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  57.67 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.93 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  59.18 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  59.18 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  55.46 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  56.8 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  56.8 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.06 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  61.08 
 
 		 354 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.41 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  59.12 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.44 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.13 
 
 		 354 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.8 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  52.85 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  54.49 
 
 		 341 aa  338  7e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  52.11 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  55.81 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  53.99 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  56.19 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  55.85 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  55.52 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.02 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  52.94 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  52.31 
 
 		 347 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  48.93 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  52.26 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.68 
 
 		 349 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 		 349 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  51.95 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  51.29 
 
 		 348 aa  315  8e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.46 
 
 		 336 aa  315  9.999999999999999e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  50.97 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  48.64 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  48.62 
 
 		 341 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  49.09 
 
 		 347 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.87 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  49.7 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  51.63 
 
 		 340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  49.24 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  51.68 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  48.14 
 
 		 340 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  50.65 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  52.89 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.39 
 
 		 341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  50.65 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  51.15 
 
 		 341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  47.01 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  51.51 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  47.38 
 
 		 447 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  43.36 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>