266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0107 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  99.53 
 
 
214 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  99.53 
 
 
214 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  99.53 
 
 
214 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  95.79 
 
 
265 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.58 
 
 
214 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.58 
 
 
214 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  83.64 
 
 
214 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  83.64 
 
 
214 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  82.24 
 
 
214 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  79.44 
 
 
214 aa  358  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  78.97 
 
 
212 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  77.57 
 
 
213 aa  343  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  78.5 
 
 
213 aa  342  3e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  68.69 
 
 
212 aa  298  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
212 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  66.82 
 
 
212 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.29 
 
 
212 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.02 
 
 
212 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.28 
 
 
211 aa  268  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.56 
 
 
214 aa  265  3e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.44 
 
 
215 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.15 
 
 
214 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.61 
 
 
224 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.56 
 
 
212 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
211 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.91 
 
 
211 aa  258  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.13 
 
 
258 aa  258  5e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.22 
 
 
214 aa  258  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.5 
 
 
211 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.62 
 
 
215 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.75 
 
 
239 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.34 
 
 
213 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
211 aa  255  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.09 
 
 
215 aa  254  1e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.01 
 
 
213 aa  253  1e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.15 
 
 
217 aa  254  1e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.14 
 
 
225 aa  252  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.69 
 
 
217 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.32 
 
 
226 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
212 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
210 aa  247  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.32 
 
 
229 aa  245  5e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
213 aa  244  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  58.02 
 
 
217 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.94 
 
 
217 aa  241  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.07 
 
 
215 aa  240  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.6 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.87 
 
 
214 aa  234  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.34 
 
 
217 aa  234  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.67 
 
 
215 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.4 
 
 
211 aa  233  1e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
212 aa  233  2e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
212 aa  233  2e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.28 
 
 
215 aa  233  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.28 
 
 
215 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.28 
 
 
215 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.74 
 
 
215 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.88 
 
 
215 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.88 
 
 
215 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.77 
 
 
211 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.43 
 
 
202 aa  225  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.16 
 
 
215 aa  223  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.42 
 
 
215 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.95 
 
 
215 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.47 
 
 
213 aa  218  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.92 
 
 
218 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.17 
 
 
231 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.08 
 
 
215 aa  212  3e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
215 aa  213  3e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.8 
 
 
261 aa  211  6e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  49.06 
 
 
212 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.42 
 
 
233 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.06 
 
 
212 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.07 
 
 
222 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
227 aa  207  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.88 
 
 
225 aa  207  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.23 
 
 
212 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.06 
 
 
200 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.06 
 
 
217 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
214 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01070  pyridoxamine-phosphate oxidase, putative  49.53 
 
 
268 aa  205  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
221 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
210 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.83 
 
 
224 aa  205  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.91 
 
 
227 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.17 
 
 
218 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.13615  normal  0.054118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
213 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
212 aa  201  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.91 
 
 
212 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
217 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
217 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2277  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.91 
 
 
212 aa  201  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.58541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
221 aa  200  1e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.11 
 
 
232 aa  200  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>