45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0078 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0332    100 
 
 
1481 bp  2849    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0656381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0078    100 
 
 
1446 bp  2866    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.604577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  99.17 
 
 
1497 bp  2789    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  99.04 
 
 
1497 bp  2773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  100 
 
 
1446 bp  2866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  100 
 
 
1446 bp  2866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  99.04 
 
 
1497 bp  2773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0694  hypothetical protein  91.88 
 
 
1434 bp  944    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0701  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  85.01 
 
 
1332 bp  454  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344652  normal  0.544688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2644  tagatose-6-phosphate kinase  84.39 
 
 
1359 bp  436  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2512  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  84.06 
 
 
1359 bp  416  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2620  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  83.89 
 
 
1353 bp  408  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634192  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2596  tagatose-6-phosphate kinase  83.64 
 
 
1353 bp  381  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1986  tagatose-6-phosphate kinase  83.64 
 
 
1353 bp  381  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  82.63 
 
 
1353 bp  305  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  82.77 
 
 
1356 bp  291  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0640  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  90.77 
 
 
1284 bp  81.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.581785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4765  tagatose-6-phosphate kinase  89.23 
 
 
1281 bp  73.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.648377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0291  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  90.91 
 
 
1278 bp  69.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.849518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0262  Tagatose-6-phosphate kinase  90.91 
 
 
1296 bp  69.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4847  tagatose-6-phosphate kinase  85.9 
 
 
1278 bp  67.9  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5361  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  91.84 
 
 
1299 bp  65.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583103  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4762  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  95 
 
 
1302 bp  63.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.715507  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3587  hypothetical protein  89.09 
 
 
1281 bp  61.9  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00157379  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3848  tagatose-6-phosphate kinase  88.14 
 
 
1284 bp  61.9  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3444  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  87.1 
 
 
1326 bp  60  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  88.68 
 
 
1287 bp  58  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  86.15 
 
 
1272 bp  58  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  85.48 
 
 
1272 bp  52  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2534  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  96.67 
 
 
1287 bp  52  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  100 
 
 
4332 bp  52  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2700  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  96.67 
 
 
1287 bp  52  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2601  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  96.67 
 
 
1287 bp  52  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  96.55 
 
 
1374 bp  50.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3515  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  91.89 
 
 
1326 bp  50.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  100 
 
 
2418 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  100 
 
 
1047 bp  48.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1753  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  100 
 
 
456 bp  48.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  93.75 
 
 
1104 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  91.67 
 
 
2136 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  93.75 
 
 
1104 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1867  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
864 bp  48.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0147455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  100 
 
 
1689 bp  48.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  96.43 
 
 
921 bp  48.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1940  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
894 bp  48.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>