More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0067 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2453  xanthine permease  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0067  xanthine permease  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0619  putative purine permease YgfU  99.43 
 
 
180 aa  336  9e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.353499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  99.4 
 
 
457 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  99.4 
 
 
457 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  99.4 
 
 
457 aa  326  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  98.81 
 
 
479 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  95.83 
 
 
458 aa  315  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  95.24 
 
 
458 aa  314  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
458 aa  314  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  94.64 
 
 
458 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  94.64 
 
 
457 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  94.64 
 
 
458 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  94.64 
 
 
458 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  88.1 
 
 
469 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  88.69 
 
 
471 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  86.9 
 
 
469 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  63.78 
 
 
482 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  63.89 
 
 
469 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  64.53 
 
 
463 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  63.33 
 
 
469 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  62.37 
 
 
468 aa  219  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  64.37 
 
 
468 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  67.09 
 
 
466 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  67.09 
 
 
466 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  60.44 
 
 
465 aa  207  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  66.45 
 
 
465 aa  204  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  67.68 
 
 
490 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  63.1 
 
 
482 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  61.71 
 
 
466 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  63.1 
 
 
525 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  63.22 
 
 
495 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  62.5 
 
 
525 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0781  putative permease transmembrane protein  68.12 
 
 
533 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.654089  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  61.11 
 
 
449 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  61.88 
 
 
463 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  62.26 
 
 
431 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  56.52 
 
 
466 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  63.1 
 
 
495 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  58.29 
 
 
475 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  56.14 
 
 
457 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  58.29 
 
 
475 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  58.05 
 
 
494 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  58.58 
 
 
444 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  56.4 
 
 
446 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  57.3 
 
 
463 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  63.1 
 
 
495 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  63.1 
 
 
495 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  55.09 
 
 
458 aa  185  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  57.41 
 
 
455 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  57.41 
 
 
455 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  58.72 
 
 
496 aa  181  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  52.15 
 
 
451 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  59.76 
 
 
493 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  51.2 
 
 
449 aa  173  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  53.37 
 
 
451 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  53.37 
 
 
451 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  53.37 
 
 
451 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  62.24 
 
 
469 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  53.99 
 
 
451 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  61.54 
 
 
469 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  62.11 
 
 
499 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  50 
 
 
446 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  54.22 
 
 
459 aa  168  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  55.28 
 
 
452 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  56.13 
 
 
463 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  58.06 
 
 
489 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  50.91 
 
 
457 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  49.12 
 
 
457 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  49.7 
 
 
487 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  50 
 
 
825 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  52.29 
 
 
440 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  51.63 
 
 
440 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  49.39 
 
 
500 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  49.12 
 
 
518 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  52.35 
 
 
435 aa  150  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  49.39 
 
 
501 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  45.29 
 
 
640 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  49.09 
 
 
633 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  48.24 
 
 
493 aa  147  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  52.8 
 
 
460 aa  147  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  50 
 
 
451 aa  147  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0447  uracil-xanthine permease  48.37 
 
 
422 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0436  uracil-xanthine permease  48.37 
 
 
422 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  48.03 
 
 
422 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  41.71 
 
 
665 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>