59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0010 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 595 aa  1179    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  63.24 
 
 		 594 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  64.46 
 
 		 596 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  77.16 
 
 		 592 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  76.67 
 
 		 592 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  77.85 
 
 		 593 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 595 aa  1179    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  99.83 
 
 		 595 aa  1177    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  99.83 
 
 		 595 aa  1179    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 595 aa  1179    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 595 aa  1179    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  76.67 
 
 		 592 aa  852    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  77.51 
 
 		 592 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  76.67 
 
 		 592 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  63.58 
 
 		 594 aa  760    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  99.66 
 
 		 661 aa  1172    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  77.34 
 
 		 592 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  95.05 
 
 		 595 aa  1065    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  33.82 
 
 		 589 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.76 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  30.12 
 
 		 590 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 578 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.78 
 
 		 607 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.16 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 531 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  27.53 
 
 		 565 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 594 aa  87.8  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 560 aa  87.8  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  24.49 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  31.64 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  27.1 
 
 		 605 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  37.18 
 
 		 440 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.23 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  25.54 
 
 		 586 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  29.38 
 
 		 717 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  31.98 
 
 		 671 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 437 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.78 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  22.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  19.56 
 
 		 408 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 582 aa  47.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  37.04 
 
 		 492 aa  47  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.32 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  24.6 
 
 		 410 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  30.89 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.75 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  31.09 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  28.14 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  29.71 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 501 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  37.36 
 
 		 417 aa  44.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 588 aa  44.3  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 760 aa  43.9  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  32.33 
 
 		 459 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>