More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2537 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  99.41 
 
 		 340 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  99.41 
 
 		 340 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 		 340 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  99.71 
 
 		 340 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  98.83 
 
 		 341 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  99.12 
 
 		 341 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  98.53 
 
 		 341 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  89.94 
 
 		 340 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  80 
 
 		 340 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  78.82 
 
 		 340 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  79.12 
 
 		 340 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  79.12 
 
 		 340 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  79.12 
 
 		 340 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  77.35 
 
 		 340 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  80 
 
 		 340 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  72.35 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  70.87 
 
 		 341 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 		 340 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 		 340 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  70.59 
 
 		 340 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  64.18 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  71.18 
 
 		 340 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  61.72 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  48.96 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  47.77 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  45.3 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  48.26 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  48.05 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  48.34 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  46.02 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  45.32 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  45.99 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  43.71 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  41.57 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.51 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  41.28 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  43.02 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 		 342 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  41.57 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  40.7 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  42.45 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  40.29 
 
 		 361 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  43.71 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  43.14 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  43.6 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  45.92 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.83 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  42.69 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  41.79 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  42.11 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  40.87 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  37.9 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  43.83 
 
 		 577 aa  203  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 578 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  38.57 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  40.29 
 
 		 345 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  39.07 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  38.3 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  42.47 
 
 		 582 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  39.08 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.47 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.04 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  37.24 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  33.1 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  40.47 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.37 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.4 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.93 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.17 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.77 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 385 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.96 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.36 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  46.11 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  43.82 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.93 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.93 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  38.03 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  30.87 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  40.25 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  39.56 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  40.64 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  40.64 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>