More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2366 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.8 
 
 
510 aa  1036    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.8 
 
 
510 aa  1038    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
510 aa  1040    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.22 
 
 
510 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.8 
 
 
510 aa  1038    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.8 
 
 
510 aa  1036    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
510 aa  1040    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 
536 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  34.35 
 
 
554 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  32.89 
 
 
554 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  33.48 
 
 
503 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  33.84 
 
 
553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
552 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  33.4 
 
 
557 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  33.21 
 
 
554 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
554 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
554 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
554 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  32.7 
 
 
554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  35.32 
 
 
498 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  32.7 
 
 
554 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  32.95 
 
 
554 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  34.45 
 
 
554 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
554 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  34.04 
 
 
554 aa  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  33.08 
 
 
554 aa  230  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.76 
 
 
498 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  32.19 
 
 
554 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  34.01 
 
 
555 aa  229  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  31.95 
 
 
554 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  32.05 
 
 
554 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  32.95 
 
 
554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  30.44 
 
 
554 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  32.77 
 
 
554 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  32.77 
 
 
554 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  32.77 
 
 
554 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  34.6 
 
 
554 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  31.89 
 
 
555 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  31.69 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  33.26 
 
 
554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  31.86 
 
 
554 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  30.94 
 
 
554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  33.05 
 
 
554 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  30.5 
 
 
556 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  31.76 
 
 
554 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  30.69 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  32.62 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  33.9 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  33.9 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  33.9 
 
 
554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  33.19 
 
 
543 aa  213  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  32.53 
 
 
596 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  32.71 
 
 
556 aa  209  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  31.03 
 
 
571 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  32 
 
 
556 aa  206  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  32.7 
 
 
554 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.52 
 
 
592 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  28.75 
 
 
573 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.82 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  30.8 
 
 
564 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.89 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  30.27 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  30.38 
 
 
563 aa  183  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.6 
 
 
514 aa  183  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  30.24 
 
 
537 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0993  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.13 
 
 
617 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000224185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  30.3 
 
 
563 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.79 
 
 
530 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  30.11 
 
 
563 aa  180  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  30.67 
 
 
482 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.35 
 
 
678 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.77 
 
 
484 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 
513 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  29.86 
 
 
638 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.54 
 
 
591 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.7 
 
 
592 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 
513 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.81 
 
 
617 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0300224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.48 
 
 
643 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.29 
 
 
513 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29 
 
 
528 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.89 
 
 
603 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.52 
 
 
660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.13 
 
 
635 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.35 
 
 
660 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.9 
 
 
598 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.5 
 
 
600 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  29.64 
 
 
530 aa  167  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.34 
 
 
607 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.91 
 
 
588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.39 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.9 
 
 
595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.68 
 
 
610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>