More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1215 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  100 
 
 		 467 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  100 
 
 		 467 aa  894    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  99.15 
 
 		 468 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  99.36 
 
 		 1046 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  96.37 
 
 		 606 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  100 
 
 		 467 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  100 
 
 		 467 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  99.15 
 
 		 468 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  75.85 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  75.17 
 
 		 455 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  72.47 
 
 		 465 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  38.03 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  38.6 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  36.64 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  36.36 
 
 		 403 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 404 aa  240  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  35.27 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  34.88 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  35.82 
 
 		 403 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  34.16 
 
 		 403 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  34.64 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  35.51 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  35.16 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  34.68 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  35.54 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  35.1 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  34.56 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  33.56 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.47 
 
 		 389 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.47 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  27.47 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  30.79 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.6 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  36.95 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  28.9 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 421 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  27.83 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  26.6 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.44 
 
 		 895 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 420 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  28.48 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.72 
 
 		 912 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.92 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.92 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.23 
 
 		 426 aa  113  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.38 
 
 		 917 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  27.79 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  27.46 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>