73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1153 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  100 
 
 
256 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  100 
 
 
256 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  99.6 
 
 
252 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  99.21 
 
 
252 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  99.6 
 
 
252 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  98.74 
 
 
239 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  89 
 
 
264 aa  304  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  71.86 
 
 
240 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  72.73 
 
 
239 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  65.97 
 
 
238 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  70.59 
 
 
242 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  72.73 
 
 
240 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  65.13 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  76.43 
 
 
243 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  54.11 
 
 
250 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  57.42 
 
 
233 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  61.69 
 
 
248 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  58.16 
 
 
233 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  47.57 
 
 
233 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  48.06 
 
 
236 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  44.83 
 
 
253 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  38.25 
 
 
208 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  37.37 
 
 
207 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  39.46 
 
 
192 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  38.73 
 
 
195 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  32.65 
 
 
207 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  33.51 
 
 
207 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.56 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  35.98 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  33.51 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  31.71 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  32.16 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  34.2 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  34.69 
 
 
196 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.16 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.51 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  32.62 
 
 
188 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.44 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  34.38 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  33.73 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  32.96 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  33.54 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  33.1 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.04 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.23 
 
 
201 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.35 
 
 
209 aa  62.4  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  33.87 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  27.32 
 
 
203 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  31.52 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.77 
 
 
198 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  29.71 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.42 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  27.11 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  31.45 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.38 
 
 
197 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  35 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  26.51 
 
 
188 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.03 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  29.13 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  29.26 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.21 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  30.85 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  30.85 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  32.84 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  28.42 
 
 
214 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>