More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1044 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
460 aa  905    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  84.78 
 
 
460 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
460 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
510 aa  904    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.78 
 
 
510 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  85.65 
 
 
460 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  80.22 
 
 
459 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.78 
 
 
460 aa  904    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  95.65 
 
 
561 aa  850    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  87.61 
 
 
460 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  80.43 
 
 
459 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.09 
 
 
460 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  85 
 
 
460 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  79.35 
 
 
459 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
460 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.09 
 
 
460 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.09 
 
 
460 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.57 
 
 
460 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0596  exodeoxyribonuclease VII large subunit  65.07 
 
 
448 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000355871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0538  exodeoxyribonuclease VII large subunit  62.64 
 
 
481 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839459  unclonable  0.0000000860109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.41 
 
 
469 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.68 
 
 
440 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.59 
 
 
467 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.23 
 
 
450 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1511  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.99 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.823365  normal  0.344595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.42 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.95 
 
 
408 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.79 
 
 
406 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.63 
 
 
447 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.11 
 
 
457 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.5 
 
 
439 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.49 
 
 
436 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.19 
 
 
446 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.14 
 
 
436 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.58 
 
 
454 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.61 
 
 
443 aa  339  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.24 
 
 
445 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.28 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.06 
 
 
445 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.14 
 
 
446 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.73 
 
 
451 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  43.07 
 
 
450 aa  328  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.69 
 
 
443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2482  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.59 
 
 
447 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.780603  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2552  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.06 
 
 
432 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.27 
 
 
457 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.03 
 
 
436 aa  322  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.23 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  40.23 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
456 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
449 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
456 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
449 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3152  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.74 
 
 
472 aa  319  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.782441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.14 
 
 
449 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.55 
 
 
467 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.14 
 
 
449 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.33 
 
 
448 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.68 
 
 
461 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.16 
 
 
444 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.49 
 
 
455 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  47.1 
 
 
447 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  43.06 
 
 
452 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.18 
 
 
464 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.95 
 
 
476 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.5 
 
 
462 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.72 
 
 
465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.8 
 
 
453 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.47 
 
 
414 aa  313  5.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.41 
 
 
448 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.35 
 
 
447 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.01 
 
 
414 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4890  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.47 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.25 
 
 
458 aa  307  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.6 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.73 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.7 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.82 
 
 
458 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.63 
 
 
455 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.85 
 
 
456 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40 
 
 
463 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.78 
 
 
448 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.9 
 
 
444 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.96 
 
 
458 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.8 
 
 
448 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.78 
 
 
448 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.35 
 
 
445 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.49 
 
 
458 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40 
 
 
463 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.57 
 
 
448 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.61 
 
 
445 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.27 
 
 
448 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.03 
 
 
446 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.59 
 
 
459 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.56 
 
 
448 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.22 
 
 
466 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>