More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0653 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  97.45 
 
 
274 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.04 
 
 
274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  83.94 
 
 
274 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.82 
 
 
274 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.94 
 
 
274 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.94 
 
 
274 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.94 
 
 
274 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  78.47 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.1 
 
 
274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.7 
 
 
283 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.6 
 
 
283 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  71.37 
 
 
282 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  63.71 
 
 
272 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.67 
 
 
271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  63.98 
 
 
271 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.26 
 
 
271 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.62 
 
 
272 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.76 
 
 
289 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.69 
 
 
271 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  59.84 
 
 
289 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.77 
 
 
267 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.72 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.08 
 
 
274 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.7 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
285 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
286 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  30.93 
 
 
277 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  31.22 
 
 
269 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
269 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
259 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 
273 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.5 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  32.29 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.69 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  29.5 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  30.29 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.33 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
262 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.97 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
290 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.82 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4913  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.08 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2075  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.11 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157073  unclonable  1.0749900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
226 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  31.4 
 
 
229 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5067  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517347  normal  0.476874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.24 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5187  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.696708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0350  ABC transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 
306 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0221605  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  36.56 
 
 
282 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
306 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0634047  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  29.02 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  30.81 
 
 
228 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.61 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.18 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  28.9 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.82 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  34.41 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  34.05 
 
 
279 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4970  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 
306 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374231  normal  0.0875493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
292 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0268299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
306 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.039013  normal  0.0178286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3425  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.54 
 
 
306 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0399054 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>