24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0543 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  99.19 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  99.19 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  98.39 
 
 
159 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  47.01 
 
 
123 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  47.01 
 
 
123 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0022  hypothetical protein  39.45 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831793  normal  0.341515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2993  hypothetical protein  32.74 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  37.39 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  32.77 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  32.76 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3282  hypothetical protein  27.88 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  29.2 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  29.2 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  26.96 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  19.44 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>