249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0477 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.51 
 
 		 788 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.79 
 
 		 797 aa  730    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.17 
 
 		 781 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.13 
 
 		 765 aa  740    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  99.25 
 
 		 810 aa  1590    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  52.5 
 
 		 808 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  90.85 
 
 		 766 aa  1346    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.03 
 
 		 782 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.27 
 
 		 789 aa  651    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  50.13 
 
 		 790 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  99.87 
 
 		 782 aa  1558    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  100 
 
 		 803 aa  1602    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  99.13 
 
 		 803 aa  1588    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  99.75 
 
 		 803 aa  1598    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.17 
 
 		 797 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  52.02 
 
 		 790 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.84 
 
 		 815 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  42.47 
 
 		 815 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  42.58 
 
 		 815 aa  631  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.75 
 
 		 794 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.16 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  36.86 
 
 		 804 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  35.61 
 
 		 786 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.21 
 
 		 849 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.98 
 
 		 794 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  35.96 
 
 		 842 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  35.21 
 
 		 803 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  35.3 
 
 		 766 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  35.34 
 
 		 766 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  34.96 
 
 		 766 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  34.96 
 
 		 984 aa  363  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.83 
 
 		 807 aa  363  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  34.83 
 
 		 814 aa  363  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.84 
 
 		 766 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.84 
 
 		 766 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.29 
 
 		 748 aa  361  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.83 
 
 		 816 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.97 
 
 		 834 aa  348  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.92 
 
 		 785 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  35.88 
 
 		 783 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.15 
 
 		 775 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.42 
 
 		 790 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.75 
 
 		 791 aa  257  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.32 
 
 		 754 aa  230  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.9 
 
 		 778 aa  218  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.21 
 
 		 798 aa  208  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  25.46 
 
 		 765 aa  194  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  27.14 
 
 		 788 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.46 
 
 		 834 aa  168  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.81 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.05 
 
 		 778 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.09 
 
 		 778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.4 
 
 		 778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.62 
 
 		 852 aa  102  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.28 
 
 		 1040 aa  97.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.94 
 
 		 837 aa  95.9  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.4 
 
 		 866 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  24.73 
 
 		 850 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  24.73 
 
 		 833 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.33 
 
 		 833 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  24.46 
 
 		 833 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.04 
 
 		 878 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.18 
 
 		 867 aa  88.2  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  23.04 
 
 		 878 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  24.8 
 
 		 870 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  23.04 
 
 		 878 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.56 
 
 		 901 aa  87  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.16 
 
 		 857 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  22.77 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  24.66 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  23.15 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  24.66 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.16 
 
 		 880 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.6 
 
 		 840 aa  84.3  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  23.01 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.42 
 
 		 901 aa  84  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  24.18 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  24.4 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  24.53 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  25.04 
 
 		 939 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.18 
 
 		 890 aa  80.9  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.81 
 
 		 859 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.63 
 
 		 867 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  29.17 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  23.81 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  25.04 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  24.55 
 
 		 913 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  25.04 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  24.31 
 
 		 914 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  24.55 
 
 		 914 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  25.04 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  25.04 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.46 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.05 
 
 		 856 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.59 
 
 		 861 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  25 
 
 		 842 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.87 
 
 		 869 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.42 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  24.87 
 
 		 869 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.91 
 
 		 850 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>