51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0426 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  99.78 
 
 		 454 aa  899    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  99.78 
 
 		 454 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  99.78 
 
 		 454 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  900    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  93.3 
 
 		 454 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  99.55 
 
 		 454 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  66.52 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  66.83 
 
 		 453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  66.99 
 
 		 453 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  64.9 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  66.91 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  65.14 
 
 		 453 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  66.91 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  51.42 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  50.33 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  31.98 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.18 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.35 
 
 		 591 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.95 
 
 		 568 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  28.82 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 		 394 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  28.72 
 
 		 559 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.1 
 
 		 566 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.99 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  26.52 
 
 		 548 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  34.65 
 
 		 333 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  35.39 
 
 		 335 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  31.9 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  27.56 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.47 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  30.63 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  27.56 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  37.61 
 
 		 143 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  33.04 
 
 		 1334 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  31.36 
 
 		 287 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  29.66 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  34.86 
 
 		 1381 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.55 
 
 		 954 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  28.08 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 338 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  37.84 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  27.97 
 
 		 3121 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  29 
 
 		 350 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>