59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1873 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  99.79 
 
 
484 aa  947  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  86.57 
 
 
488 aa  792  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  75.78 
 
 
488 aa  699  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  76.4 
 
 
488 aa  719  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  85.54 
 
 
488 aa  761  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  96.9 
 
 
488 aa  887  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  86.57 
 
 
488 aa  791  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  85.74 
 
 
488 aa  763  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  85.92 
 
 
498 aa  765  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
488 aa  948  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  86.57 
 
 
488 aa  792  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  86.34 
 
 
488 aa  761  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
484 aa  948  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
488 aa  948  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
484 aa  948  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  100 
 
 
484 aa  948  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  99.79 
 
 
484 aa  947  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  71.25 
 
 
492 aa  661  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  53.21 
 
 
486 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 
478 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  33.26 
 
 
499 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  33.26 
 
 
499 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 
488 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 
473 aa  183  5e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
422 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 
429 aa  127  4e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
509 aa  123  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  31.56 
 
 
424 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
468 aa  110  8e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
419 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
504 aa  79  2e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
499 aa  67.4  6e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
497 aa  64.7  3e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
504 aa  59.3  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  25.92 
 
 
506 aa  58.5  3e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
533 aa  57  8e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  19.83 
 
 
501 aa  56.6  9e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
507 aa  53.9  7e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  42.47 
 
 
507 aa  53.5  8e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.92 
 
 
484 aa  53.1  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
427 aa  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  5.72815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.18 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.93 
 
 
504 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  34.78 
 
 
511 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 
519 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  18.78 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  1.36517e-07 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
514 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 
492 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 
443 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>