More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1809 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  64.92 
 
 
501 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  64.65 
 
 
503 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  83.37 
 
 
507 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
506 aa  1026    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  62.5 
 
 
520 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  99.41 
 
 
506 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  64.1 
 
 
502 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  84.68 
 
 
511 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  63.69 
 
 
503 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  63.91 
 
 
502 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  99.8 
 
 
506 aa  1024    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  84.6 
 
 
507 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  77 
 
 
515 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  96.44 
 
 
506 aa  991    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  99.8 
 
 
509 aa  1024    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  83.76 
 
 
507 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  64.66 
 
 
501 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  78.69 
 
 
513 aa  809    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 
502 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  76.94 
 
 
521 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
506 aa  1026    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  83.76 
 
 
507 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  83.97 
 
 
507 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  99.41 
 
 
506 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  63.51 
 
 
502 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  83.76 
 
 
507 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 
502 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  59.92 
 
 
523 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  61.08 
 
 
564 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  61.08 
 
 
546 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  61.08 
 
 
561 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  61.08 
 
 
564 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  61.76 
 
 
562 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  61.08 
 
 
564 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  61.08 
 
 
564 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  55.21 
 
 
569 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  56.31 
 
 
509 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  55.4 
 
 
504 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.07 
 
 
507 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  50.3 
 
 
488 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  48.27 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.87 
 
 
501 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 
501 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  47.83 
 
 
501 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.51 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.58 
 
 
495 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.42 
 
 
497 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.33 
 
 
503 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  48.76 
 
 
502 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.25 
 
 
494 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
495 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  44.4 
 
 
490 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
496 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.63 
 
 
489 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
501 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
492 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  40.04 
 
 
488 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 
488 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 
488 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  42.45 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  42.74 
 
 
488 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  40.26 
 
 
495 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
488 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.88 
 
 
491 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
490 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  42.02 
 
 
502 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
511 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
492 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
470 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
498 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.09 
 
 
507 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  41.53 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
507 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.8 
 
 
495 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  40.41 
 
 
502 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
485 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
487 aa  312  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.16 
 
 
485 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  38.36 
 
 
485 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.96 
 
 
494 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
486 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
490 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  37.77 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
485 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
505 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.63 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.31 
 
 
499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.39 
 
 
499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.24 
 
 
514 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  39.55 
 
 
490 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 
520 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
475 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
515 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>