More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1610 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  99.71 
 
 
369 aa  679  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  682  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  675  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  682  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  682  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  99.71 
 
 
369 aa  679  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  96.87 
 
 
374 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  88.32 
 
 
387 aa  562  1e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  68.65 
 
 
327 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  69.47 
 
 
324 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  70.09 
 
 
324 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  70.09 
 
 
324 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.85 
 
 
338 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  70.89 
 
 
322 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  67.56 
 
 
334 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  68.35 
 
 
322 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  67.06 
 
 
338 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  67.55 
 
 
338 aa  416  1e-115  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  68.67 
 
 
322 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  64.58 
 
 
327 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  69.18 
 
 
321 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  57.59 
 
 
327 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  56.78 
 
 
321 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  56.78 
 
 
321 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  56.78 
 
 
321 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  56.78 
 
 
321 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  56.78 
 
 
321 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  56.78 
 
 
321 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  53.01 
 
 
335 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  45.31 
 
 
320 aa  306  5e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  47.19 
 
 
320 aa  305  1e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  50.3 
 
 
338 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  51.71 
 
 
339 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  48.58 
 
 
325 aa  282  6e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  51.42 
 
 
317 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  49.71 
 
 
363 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 
324 aa  273  4e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  44.82 
 
 
354 aa  273  5e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.79 
 
 
336 aa  272  8e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  47.75 
 
 
334 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  49.22 
 
 
334 aa  270  3e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 
311 aa  269  6e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 
311 aa  269  6e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  52.78 
 
 
323 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  62.26 
 
 
215 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.87 
 
 
312 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  56.98 
 
 
437 aa  266  3e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 
336 aa  267  3e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  47.51 
 
 
375 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  45.57 
 
 
319 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  43.79 
 
 
342 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  45.95 
 
 
362 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  48.01 
 
 
327 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
338 aa  262  5e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  46.23 
 
 
321 aa  261  9e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  46.23 
 
 
321 aa  261  9e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 
320 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
321 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  48.64 
 
 
351 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  48.16 
 
 
338 aa  259  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 
328 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 
312 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  47.32 
 
 
345 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  42.41 
 
 
349 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 
344 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 
344 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  48.77 
 
 
334 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  45.82 
 
 
341 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
344 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  49.84 
 
 
310 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  48.77 
 
 
334 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 
341 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
336 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 
344 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 
344 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  44.51 
 
 
331 aa  254  2e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 
332 aa  253  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  47 
 
 
344 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 
344 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 
315 aa  253  5e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
329 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
357 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  47.11 
 
 
346 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 
327 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  47.83 
 
 
328 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  50.94 
 
 
320 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
325 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  45.9 
 
 
331 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 
322 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
321 aa  245  7e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 
330 aa  245  7e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 
338 aa  244  1e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  47.89 
 
 
333 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  48.38 
 
 
312 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 
321 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  45.02 
 
 
329 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
334 aa  240  3e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 
345 aa  239  7e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 
358 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>