29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1358 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  99.68 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  99.68 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  99.68 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  74.45 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  68.59 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  68.59 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  68.55 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  69.3 
 
 
315 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  53.5 
 
 
327 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.85 
 
 
327 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  49.54 
 
 
310 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  47.11 
 
 
310 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.61 
 
 
310 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  40.61 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.02 
 
 
349 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  34.88 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.02 
 
 
291 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.86 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.37 
 
 
312 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  34.27 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  39.62 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.7 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.05 
 
 
551 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  34.07 
 
 
615 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  56.25 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>