More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0872 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  99.7 
 
 
354 aa  681  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  99.11 
 
 
336 aa  677  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
336 aa  684  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  99.7 
 
 
336 aa  682  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
336 aa  684  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
336 aa  684  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  99.4 
 
 
354 aa  679  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  83.6 
 
 
315 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  84.09 
 
 
315 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  84.09 
 
 
315 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  83.44 
 
 
315 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  75.48 
 
 
331 aa  491  1e-138  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  7.20419e-06 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 
331 aa  493  1e-138  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  72.07 
 
 
332 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  60.77 
 
 
313 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  61.44 
 
 
312 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  60.77 
 
 
313 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  61.56 
 
 
312 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
313 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
313 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
313 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  60.46 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
312 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  56.73 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  56.73 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  57.84 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  58.17 
 
 
317 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  57.05 
 
 
317 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
315 aa  356  4e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
315 aa  356  4e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
315 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 
322 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
315 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  54.78 
 
 
315 aa  343  3e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  55.56 
 
 
332 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
316 aa  329  5e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
316 aa  329  5e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
316 aa  329  5e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 
334 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 
313 aa  321  1e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  51.14 
 
 
355 aa  320  2e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 
327 aa  319  4e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  51.66 
 
 
323 aa  318  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
329 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  52.44 
 
 
314 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
313 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
329 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  52.12 
 
 
314 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 
313 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  51.14 
 
 
312 aa  314  1e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
317 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
327 aa  304  1e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
323 aa  303  3e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
430 aa  302  6e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
312 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  49.17 
 
 
431 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
322 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 
323 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
322 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
322 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
322 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
322 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
322 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
318 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  48.37 
 
 
311 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
308 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
352 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
308 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
328 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
328 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
328 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
323 aa  251  9e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
310 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
310 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
310 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
310 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
324 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
315 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
320 aa  214  1e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 
299 aa  213  3e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.07 
 
 
305 aa  213  3e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
303 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
355 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
307 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
306 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  40.68 
 
 
312 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>