More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0693 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
255 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  85.41 
 
 
245 aa  406  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  84.98 
 
 
243 aa  405  1e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
264 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
241 aa  115  7e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 
257 aa  112  4e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  110  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.99292e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
228 aa  110  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
228 aa  110  2e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.56729e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.51748e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.22448e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.49692e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
228 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 
228 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.55657e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  31.6 
 
 
231 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
228 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
228 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
228 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
226 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 
228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
248 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
230 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
255 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
225 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 
232 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.58 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.93003e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  28.89 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 
234 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  9.72767e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  23.26 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
238 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
238 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
234 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 
239 aa  84  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
237 aa  84.3  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
234 aa  83.2  3e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 
239 aa  82.8  5e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
227 aa  82.8  5e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 
234 aa  82  8e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
229 aa  81.3  1e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
230 aa  79  6e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
265 aa  79  7e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  22.61 
 
 
230 aa  76.3  4e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 
211 aa  76.3  5e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
221 aa  75.5  7e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  30.29 
 
 
212 aa  75.1  9e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
211 aa  74.7  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
234 aa  73.9  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
267 aa  73.9  2e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
227 aa  74.3  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
238 aa  73.9  2e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
256 aa  73.6  3e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
262 aa  72.8  5e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
284 aa  72.8  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
226 aa  72.4  6e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
218 aa  72.4  6e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
240 aa  72.4  7e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
223 aa  71.6  1e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 
236 aa  71.6  1e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  3.5042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
239 aa  70.9  2e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
230 aa  70.9  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>