56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0546 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  93.14 
 
 
626 aa  1055  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  74 
 
 
557 aa  845  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  77.9 
 
 
555 aa  878  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  79.16 
 
 
557 aa  882  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  78.44 
 
 
555 aa  889  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  79.16 
 
 
557 aa  885  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  80.55 
 
 
555 aa  882  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  76 
 
 
564 aa  864  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  79.16 
 
 
557 aa  882  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  99.82 
 
 
554 aa  1123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  79.02 
 
 
555 aa  891  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  99.82 
 
 
554 aa  1122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  74.24 
 
 
573 aa  852  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  2.3235e-06 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  53.45 
 
 
544 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  52.69 
 
 
558 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  35.58 
 
 
541 aa  304  3e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  36.38 
 
 
554 aa  293  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  35.71 
 
 
540 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  33.59 
 
 
533 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.32 
 
 
559 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  4.38453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.49 
 
 
568 aa  84.3  6e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24 
 
 
574 aa  83.2  1e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.38 
 
 
579 aa  75.9  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25.73 
 
 
549 aa  70.5  8e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.76 
 
 
606 aa  68.2  3e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.12 
 
 
601 aa  67  8e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.58 
 
 
617 aa  64.7  4e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  64.3  5e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  64.3  5e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.78 
 
 
593 aa  64.3  6e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.78 
 
 
615 aa  63.9  8e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  25.73 
 
 
550 aa  61.6  4e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.86 
 
 
612 aa  58.2  4e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.02 
 
 
551 aa  57.8  5e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.79 
 
 
610 aa  56.2  1e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  24.57 
 
 
593 aa  55.8  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  24.08 
 
 
617 aa  55.1  3e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.14 
 
 
607 aa  55.1  3e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  22.4 
 
 
613 aa  53.9  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  24.18 
 
 
619 aa  53.5  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.18 
 
 
625 aa  52.4  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  37.93 
 
 
324 aa  52.4  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  24.93 
 
 
619 aa  50.4  9e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  25.7 
 
 
632 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  25.07 
 
 
551 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.46 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.05 
 
 
607 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  25.32 
 
 
634 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  28.75 
 
 
629 aa  44.3  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  27.05 
 
 
615 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  24.29 
 
 
555 aa  43.9  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>