34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0081 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  550  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  94.89 
 
 
294 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  55.27 
 
 
277 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
277 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
277 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
277 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  56.27 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
277 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  56.83 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
376 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  22.43 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  33.33 
 
 
210 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.5 
 
 
240 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  26.95 
 
 
245 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>