More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0079 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  94.67 
 
 		 376 aa  587  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  66.01 
 
 		 298 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  64.57 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 301 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 277 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  34.84 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  34.84 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.84 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.84 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.84 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  34.4 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  40.62 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  28.04 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  24.9 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  29.17 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  24.69 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  36.25 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  44.44 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 827 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  35.48 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  34.43 
 
 		 221 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 242 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 454 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 		 894 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 471 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.07 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  32.35 
 
 		 861 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>