14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0069 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  99.45 
 
 
266 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  99.44 
 
 
661 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  100 
 
 
645 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  100 
 
 
605 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  71.43 
 
 
647 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  70.86 
 
 
632 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  70.86 
 
 
647 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  71.43 
 
 
645 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  70.86 
 
 
645 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  70.76 
 
 
602 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  70.76 
 
 
602 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  69.14 
 
 
658 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  28.7 
 
 
968 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>