20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0039 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0946  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.69892e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2199  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  4.43154e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1582  major surface protein 3  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  2.46807e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0853  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00439999  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0039  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  1.5275e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1770  major surface protein 3  95.4 
 
 
87 aa  170  7e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014587  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3687  hypothetical protein  84.62 
 
 
83 aa  132  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000507992  normal  0.538527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4879  hypothetical protein  83.33 
 
 
83 aa  130  7e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00123249  hitchhiker  1.34527e-10 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4362  hypothetical protein  83.33 
 
 
83 aa  130  7e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.52629e-05  hitchhiker  0.000377592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0760  hypothetical protein  82.05 
 
 
83 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110621  decreased coverage  8.50392e-06 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3436  hypothetical protein  82.05 
 
 
83 aa  127  4e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.39099e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4931  hypothetical protein  82.05 
 
 
83 aa  127  4e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  4.9187e-08  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5356  hypothetical protein  80.77 
 
 
82 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.67698e-09  normal  0.0251464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2991  hypothetical protein  63.16 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6950  hypothetical protein  63.16 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194988  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2116  hypothetical protein  53.66 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2133  hypothetical protein  54.88 
 
 
91 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4261  hypothetical protein  61.97 
 
 
84 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1208  hypothetical protein  50.68 
 
 
84 aa  77.4  7e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0713  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  76.3  2e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.593256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>