More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0034 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  72.1 
 
 		 798 aa  1078    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 		 728 aa  1498    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  97.35 
 
 		 933 aa  1546    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  71.77 
 
 		 813 aa  1078    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  83.7 
 
 		 920 aa  1435    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  69.67 
 
 		 803 aa  1100    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  73.22 
 
 		 804 aa  1095    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  87.72 
 
 		 852 aa  1306    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 		 945 aa  1893    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  49.93 
 
 		 767 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  69.42 
 
 		 803 aa  1091    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  85.28 
 
 		 930 aa  1434    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  71.97 
 
 		 796 aa  1083    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  69.67 
 
 		 803 aa  1100    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  99.16 
 
 		 714 aa  1457    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  51.44 
 
 		 667 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  36.18 
 
 		 753 aa  426  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.25 
 
 		 790 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.24 
 
 		 777 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.65 
 
 		 750 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33.79 
 
 		 745 aa  357  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.38 
 
 		 727 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.38 
 
 		 751 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.24 
 
 		 728 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.88 
 
 		 733 aa  354  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.56 
 
 		 728 aa  351  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.11 
 
 		 728 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.15 
 
 		 741 aa  337  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.14 
 
 		 737 aa  335  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.16 
 
 		 728 aa  334  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.84 
 
 		 728 aa  333  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.93 
 
 		 748 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.66 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.88 
 
 		 738 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.75 
 
 		 737 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.61 
 
 		 738 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.78 
 
 		 735 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.44 
 
 		 736 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.8 
 
 		 734 aa  320  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31.33 
 
 		 738 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31.33 
 
 		 738 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.93 
 
 		 738 aa  318  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.49 
 
 		 739 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.31 
 
 		 738 aa  313  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.49 
 
 		 737 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.23 
 
 		 754 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.87 
 
 		 751 aa  303  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.72 
 
 		 735 aa  297  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.41 
 
 		 764 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.45 
 
 		 729 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  30.14 
 
 		 745 aa  282  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.87 
 
 		 771 aa  257  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.28 
 
 		 733 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.68 
 
 		 776 aa  248  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.56 
 
 		 740 aa  223  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.39 
 
 		 760 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.63 
 
 		 740 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.98 
 
 		 720 aa  188  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.48 
 
 		 707 aa  183  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.81 
 
 		 746 aa  181  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  39.37 
 
 		 256 aa  179  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.51 
 
 		 311 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.62 
 
 		 333 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.3 
 
 		 320 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.3 
 
 		 320 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.34 
 
 		 315 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.23 
 
 		 317 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.13 
 
 		 263 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  36.97 
 
 		 302 aa  167  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.67 
 
 		 293 aa  164  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  37.37 
 
 		 981 aa  164  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.46 
 
 		 330 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  39.86 
 
 		 875 aa  163  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  38.23 
 
 		 349 aa  162  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.67 
 
 		 273 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 		 474 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.2 
 
 		 308 aa  161  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  38.16 
 
 		 950 aa  160  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  37.85 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  37.85 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  38.11 
 
 		 302 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.11 
 
 		 306 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.11 
 
 		 305 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.11 
 
 		 305 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  37.85 
 
 		 306 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.68 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  37.04 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.34 
 
 		 263 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  35.98 
 
 		 345 aa  157  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.66 
 
 		 259 aa  157  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.76 
 
 		 302 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 		 358 aa  157  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.51 
 
 		 253 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  36.27 
 
 		 301 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>