More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0996 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  100 
 
 
352 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  99.43 
 
 
370 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  92.05 
 
 
352 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  99.72 
 
 
352 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  99.66 
 
 
291 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  52.4 
 
 
362 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  49.04 
 
 
346 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  49.05 
 
 
344 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  39.64 
 
 
347 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  35.37 
 
 
351 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  39.03 
 
 
350 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  42.95 
 
 
366 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  42.95 
 
 
524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  40.95 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  39.29 
 
 
349 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 
339 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 
360 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 
345 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 
366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  38.96 
 
 
331 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  41.9 
 
 
365 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  41.25 
 
 
368 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  39.33 
 
 
379 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.12 
 
 
348 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.31 
 
 
350 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 
350 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.72 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.22 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.73 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.56 
 
 
386 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 
326 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.25 
 
 
353 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.34 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  35.82 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  39.61 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.06 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.37 
 
 
380 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.12 
 
 
336 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.57 
 
 
371 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.48 
 
 
343 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.81 
 
 
306 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  35.12 
 
 
349 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.9 
 
 
369 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  34.47 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.93 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  36.96 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.78 
 
 
313 aa  119  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.52 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.66 
 
 
359 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.66 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.66 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30.55 
 
 
379 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 
347 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  24.31 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.49 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.2 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.03 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  25.65 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.25 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.11 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.29 
 
 
344 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.61 
 
 
370 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 
317 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.1 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  23.8 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.58 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.92 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.18 
 
 
367 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 
336 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.37 
 
 
341 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  34.93 
 
 
306 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  32.57 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.76 
 
 
349 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.06 
 
 
362 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 
338 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.9 
 
 
332 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  30.9 
 
 
326 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 
338 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 
338 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>