88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0562 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  99.62 
 
 		 290 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  99.62 
 
 		 290 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  99.62 
 
 		 290 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  99.62 
 
 		 290 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  99.62 
 
 		 290 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  98.87 
 
 		 290 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  99.25 
 
 		 290 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  87.4 
 
 		 289 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  88 
 
 		 294 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  87.22 
 
 		 290 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  80.38 
 
 		 296 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  87.59 
 
 		 289 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  87.88 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  87.5 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  87.88 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  87.59 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  91.84 
 
 		 289 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  54.7 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.91 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  44.14 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  28.68 
 
 		 315 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.52 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  30.94 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  28.45 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  30.94 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.73 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  27.65 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.58 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.24 
 
 		 675 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  25.41 
 
 		 686 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  26.8 
 
 		 665 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  32.17 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  26.8 
 
 		 665 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  26.8 
 
 		 665 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  26.51 
 
 		 651 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  27.13 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.51 
 
 		 654 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  22.82 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  25.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.38 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  25.3 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.61 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.87 
 
 		 613 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  24.77 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  28.02 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  25.86 
 
 		 672 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  24.07 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  27.62 
 
 		 651 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  26.38 
 
 		 681 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  29.33 
 
 		 692 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  25.86 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  27.86 
 
 		 736 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  29.03 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  26.92 
 
 		 664 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  26.15 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  28.48 
 
 		 708 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.17 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  29.95 
 
 		 676 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  24.14 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  29.33 
 
 		 632 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.93 
 
 		 718 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  26.39 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.62 
 
 		 731 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  27.23 
 
 		 691 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  27.35 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.77 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.84 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.53 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  22.22 
 
 		 319 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  25.21 
 
 		 719 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  22.53 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.19 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  22.53 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  21.91 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  21.69 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  22.53 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  27.03 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.65 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0577  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0301606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  21.74 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  23.11 
 
 		 308 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>