More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0227 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0726  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0891  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0227  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2719  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2359  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2439  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0712  LysR family transcriptional regulator  99.35 
 
 
310 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0592  LysR family transcriptional regulator  93.87 
 
 
310 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0606  LysR family transcriptional regulator  89.03 
 
 
310 aa  574  1e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2720  LysR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
310 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2080  LysR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
325 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2609  LysR family transcriptional regulator  87.42 
 
 
310 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379478  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2745  LysR family transcriptional regulator  87.42 
 
 
310 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2692  LysR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
325 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6020  LysR family transcriptional regulator  82.26 
 
 
310 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  68.4 
 
 
327 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  68.73 
 
 
327 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  69.54 
 
 
341 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2686  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
299 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2914  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 
299 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3719  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
302 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0668479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18200  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
306 aa  221  1e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3711  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
304 aa  221  2e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1579  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 
306 aa  219  4e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.03 
 
 
306 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  37.62 
 
 
309 aa  216  3e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  37.21 
 
 
311 aa  215  6e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0067  transcriptional regulator, LysR family  43.62 
 
 
304 aa  215  6e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
331 aa  214  1e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  214  1e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0591  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
304 aa  215  1e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  214  1e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2174  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
331 aa  214  1e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.52777  normal  0.0251381 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0075  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 
304 aa  213  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
305 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
333 aa  214  2e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4453  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
302 aa  212  6e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0347042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
314 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  37.54 
 
 
306 aa  212  8e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
555 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1239  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
309 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
303 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001136  transcriptional regulator  36.79 
 
 
307 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0670  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
312 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3788  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 
310 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0896823  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0735  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 
301 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
313 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.85 
 
 
304 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
304 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000622  transcriptional regulator  36.19 
 
 
311 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4112  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
300 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.69133e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1100  LysR, substrate-binding  36.33 
 
 
307 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0659  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.64 
 
 
307 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
308 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
308 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06494  transcriptional regulator  35.69 
 
 
301 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
306 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2312  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
302 aa  199  4e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0580  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
313 aa  199  4e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
309 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4064  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
304 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2713  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
323 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.995522  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1158  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
354 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 
308 aa  198  1e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 
300 aa  197  2e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0506  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
305 aa  197  2e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
311 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0668  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
309 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0472  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
303 aa  196  5e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3218  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
319 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 
303 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
304 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
297 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0453  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0755  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 
307 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 
304 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
320 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0511  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
301 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.533248  hitchhiker  0.00184272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
302 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
302 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
347 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
302 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
307 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
302 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3977  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
323 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4154  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
300 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 
307 aa  190  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 
309 aa  190  3e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 
307 aa  190  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
310 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
300 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3695  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
303 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>