252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0081 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0294  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  84.62 
 
 		 2718 bp  1852    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0081    100 
 
 		 3843 bp  7618    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0119  methionine synthase (B12-dependent)  85.74 
 
 		 2748 bp  1959    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  99.78 
 
 		 2718 bp  5340    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  99.72 
 
 		 1080 bp  2117    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0476  methionine synthase  87.76 
 
 		 2718 bp  2680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0559238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  93.33 
 
 		 1119 bp  1417    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6260  methionine synthase (B12-dependent)  92.5 
 
 		 2706 bp  3683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  99.63 
 
 		 1080 bp  2109    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  95.11 
 
 		 2718 bp  4333    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  94.72 
 
 		 1077 bp  1685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  99.67 
 
 		 2718 bp  5317    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  93.5 
 
 		 1068 bp  1445    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  84.7 
 
 		 1071 bp  769    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  93.74 
 
 		 1068 bp  1449    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4243  methionine synthase (B12-dependent)  87.39 
 
 		 2718 bp  2601    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  83.67 
 
 		 2748 bp  916    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0190  methionine synthase  87.81 
 
 		 2718 bp  2728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  92.97 
 
 		 1104 bp  1398    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0155  methionine synthase  82.66 
 
 		 2718 bp  1376    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  99.71 
 
 		 2718 bp  5325    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  94.05 
 
 		 1068 bp  1473    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2303  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  92.13 
 
 		 2718 bp  3624    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  87.06 
 
 		 1071 bp  932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  94.01 
 
 		 1068 bp  1485    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2966  methionine synthase  92.13 
 
 		 2718 bp  3677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  100 
 
 		 2718 bp  5388    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  94.05 
 
 		 1068 bp  1473    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2917  methionine synthase  92.13 
 
 		 2718 bp  3624    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2829  methionine synthase  92.71 
 
 		 2718 bp  3705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0387  methionine synthase  92.09 
 
 		 2718 bp  3669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723606  normal  0.0384626 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2932  methionine synthase  92.16 
 
 		 2718 bp  3632    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0147  methionine synthase  82.74 
 
 		 2718 bp  1608    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0214  methionine synthase (B12-dependent)  81.91 
 
 		 2724 bp  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  100 
 
 		 2718 bp  5388    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 2718 bp  5388    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  83.13 
 
 		 1080 bp  638  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0168  methionine synthase (B12-dependent)  84.69 
 
 		 2772 bp  613  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.616802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3270  methionine synthase  83.83 
 
 		 2775 bp  559  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0171  methionine synthase  87.8 
 
 		 2751 bp  549  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  82.11 
 
 		 1041 bp  476  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0165  methionine synthase  81.98 
 
 		 2790 bp  464  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0147  methionine synthase (B12-dependent)  81.98 
 
 		 2739 bp  464  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.287887  normal  0.989958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0014  methionine synthase  81.75 
 
 		 2736 bp  434  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  81.54 
 
 		 3714 bp  422  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  83.55 
 
 		 1068 bp  412  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  83.59 
 
 		 1041 bp  398  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  80.91 
 
 		 1056 bp  375  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0117  methionine synthase  83.39 
 
 		 2820 bp  365  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  81.12 
 
 		 3663 bp  361  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0232  methionine synthase  83.03 
 
 		 2757 bp  349  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  84.02 
 
 		 1041 bp  349  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  80.18 
 
 		 3699 bp  343  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  82.24 
 
 		 3837 bp  333  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0174  methionine synthase (B12-dependent)  82.42 
 
 		 2835 bp  321  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  81.45 
 
 		 3915 bp  309  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  83.41 
 
 		 1074 bp  297  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  82.93 
 
 		 3705 bp  283  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0166  methionine synthase (B12-dependent)  82.41 
 
 		 1074 bp  283  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  82.71 
 
 		 3705 bp  276  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  80.28 
 
 		 3882 bp  268  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  80.19 
 
 		 3882 bp  258  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  78.49 
 
 		 1047 bp  250  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  80.53 
 
 		 3873 bp  248  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  81.72 
 
 		 3711 bp  248  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  80.51 
 
 		 1035 bp  248  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  79.43 
 
 		 3753 bp  248  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2403  methionine synthase  89.04 
 
 		 2685 bp  244  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362073  normal  0.0953455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  79.62 
 
 		 3738 bp  234  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  80.31 
 
 		 1101 bp  234  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3402  methionine synthase  79.56 
 
 		 2670 bp  232  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.131568  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  85.66 
 
 		 3792 bp  230  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  81.31 
 
 		 3720 bp  222  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3658  hypothetical protein  79.27 
 
 		 2703 bp  222  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0544622 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  82.78 
 
 		 3687 bp  222  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  81.32 
 
 		 3708 bp  220  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  79.66 
 
 		 3753 bp  220  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3346  methionine synthase (B12-dependent)  79.09 
 
 		 2727 bp  214  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  79.56 
 
 		 3864 bp  214  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0466  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  80.36 
 
 		 2898 bp  210  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  79.6 
 
 		 3744 bp  204  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  80.25 
 
 		 3738 bp  202  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  80.57 
 
 		 3711 bp  200  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  78.92 
 
 		 3774 bp  198  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  78.87 
 
 		 3786 bp  196  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  80.21 
 
 		 3708 bp  194  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  80.21 
 
 		 3708 bp  194  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  84.01 
 
 		 3816 bp  192  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  79.09 
 
 		 2685 bp  190  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2997  methionine synthase  78.64 
 
 		 2727 bp  190  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.199846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  78.48 
 
 		 3747 bp  182  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  78.93 
 
 		 3810 bp  182  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3697    83.15 
 
 		 3918 bp  180  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  80.04 
 
 		 3708 bp  172  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  82.9 
 
 		 3723 bp  168  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  89.19 
 
 		 2622 bp  167  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>