23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0026 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0026  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0009  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000243389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1386  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309267  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0050  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651338  normal  0.744651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0050  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.568856  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0022  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0009  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>