19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0019 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0019  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>