115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1946 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  41.82 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  25.93 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  30.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  30.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  24.66 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  28.45 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 141 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 166 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 148 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.36 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>